shRNA(short hairpin RNA)是一段具有緊密發卡環的RNA序列,包括兩個短的反向重復序列和連接兩個重復序列的Loop區,是一種將小干擾RNA(siRNA)輸送到活體中的形式。siRNA序列可以作為“短發夾”結構克隆進質粒載體中,質粒進入細胞后,該發夾序列表達出來形成雙鏈RNA(dsRNA),并進入RNA干擾(RNAi)通路,最終實現基因沉默的效果。
shRNA文庫應用方向
shRNA文庫應用非常廣泛,主要應用在基因功能研究和基因治療等方面:
- 基因功能研究:利用shRNA文庫進行高通量篩選,闡明信號轉導通路、發現新的藥物作用靶點[1-3];
- 基因治療:使用腫瘤特異性啟動子如hTERT啟動子、survivin啟動子或組織特異性啟動子如酪氨酸酶啟動子、骨鈣素啟動子引導針對某些癌基因或抗凋亡分子的siRNA或shRNA表達,從而達到特異性殺傷腫瘤細胞的目的[4];
- 治療病毒性疾病: siRNA可以介導人類細胞的細胞間抗病毒免疫,病毒感染能被針對病毒基因和相關宿主基因的siRNA所阻斷[5]。
shRNA文庫服務優勢
- 可定制化對shRNA文庫載體進行改造,實現可誘導型shRNA文庫或帶有特殊篩選標記的shRNA文庫;
- shRNA文庫特性較穩定,不易降解;
- Syno? 3.0高通量合成shRNA文庫,可縮短合成周期,降低合成成本。
shRNA文庫泓迅案例
使用Syno? 3.0芯片合成的方法,可以高通量、低價格的合成shRNA序列,可定制化的構建shRNA文庫載體,并可進行慢病毒包裝服務。經過NGS驗證后,最終檢測shRNA文庫正確率在70%以上。
shRNA文庫構建流程圖
服務詳情
服務名稱 | 產品/服務內容 | 交付周期 | 交付項目 | 價格 |
shRNA文庫構建 | 合成shRNA芯片并構建文庫 | 40-50個工作日 | 液態庫質粒50-200ug,甘油菌一管 | 咨詢 |
參考文獻
[1] A comparison of multiple shRNA expression methods for combinatorial RNAi. Genet Vaccines Ther. 2011 Apr 17 [2] shRNA library screening identifies nucleocytoplasmic transport as a mediator of BCR-ABL1 kinase-independent resistance. Blood. 2015 Mar 12 [3] shRNA screening identifies JMJD1C as being required for leukemia maintenance. Blood. 2014 Mar 20 [4] Construction of a novel vector expressing the fusion suicide gene yCDglyTK and hTERT-shRNA and its antitumor effects. Exp Ther Med. 2012 Sep;4(3):442-448 [5]Qiu Y, Xu Y, Zhou X.Human virus-derived small RNAs can confer antiviral immunity in mammals. Immunity. 2017 Jun 20;46(6):992-1004shRNA文庫構建服務訂購與咨詢
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